清華大學校友會與中國大陸廈門市政府、北京清華大學在新竹清華大學校內育成大樓共設「清華海峽研究院」、「清華海峽研究院新竹辦公室」，遭質疑中國大陸共產黨勢力入侵。民進黨立委范雲要求教育部啟動調查、釐清責任，且依據兩岸人民關係條例的相關規定，即刻處理。也將要求教育部與陸委會跨部會密切合作，討論如何全面防範台灣高教被滲透。
教育部指出，針對清華大學將校內空間租供清華海峽研究院（新竹辦公室），作為辦公處所部分，本部已督導國立清華大學依該校場地設備管理使用相關規定，針對本案違背法令情事，立即停止其使用並即刻撤離。
范雲指出，台灣面對中共的滲透，必須強硬阻絕，大學自治不是放任中共滲透的藉口，教育部要負起徹查責任，不能再有下一個事件除了處理單一個案，依據相關法規重罰外，教育部還必須展開全面調查、通案處理。釐清其他學校是否有類似的狀況。
